Pokémon Ultrasonne & Ultramond sollen ein doppelt so langes Story-Szenario bieten wie die Originalspiele. Das geht aus einem Interview des japanischen Magazins Famitsu mit Producer Shigeru Ohmori und Director Kazumasa Iwao hervor.
Nach Pokémon Sonne & Mond habe man das Bedürfnis gehabt weiter mit der Spielregion Alola zu arbeiten. Mit Pokémon Ultrasonne & Ultramond wolle man Alola mit mehr Abwechslung versehen, bevor sich ein Bild von der Spielregion bei den Spielern verfestigt. Dennoch seien die Spiele keine Fortsetzung, so Ohmori und Iwao. Viel mehr erzählen die Spiele eine Handlung, die in manchen Punkten von den Originalspielen abweicht. Mit dem Auftauchen des Ultraforschungsteams soll die Geschichte eine andere Richtung einnehmen. Da das Team bereits sehr früh auftaucht, wird man direkt vom Spielbeginn an Unterschiede bemerken. Zusätzlich zur Haupthandlung wird es eine weitere Episode geben, sobald man die Ruhmeshalle betreten hat. Wer befürchtet, dass die Unterschiede nur minimal wie beispielsweise in Pokémon Smaragd und Pokémon Platin ausfallen werden, dürfen beruhigt sein. Ohmori und Iwao versprechen deutlich größere Änderungen.
Spieler werden außerdem in der Lage sein durch die Ultrapforte zu reisen und verschiedene Welten zu besuchen. Ohmori und Iwao verrieten, dass es Welten geben wird, in denen man auf legendäre Pokémon treffen kann. Zu diesen Pokémon soll beispielsweise Mewtu gehören...